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尽管穆斯林迅速控制了大部分肥沃的土地，但他们仍然是一个明显的少数群体。
基督教社区保持了较大程度的自治，但整个奥斯曼时期都标志着基督教人口从平原迁往山区的现象。
这导致了山中强盗和叛乱者的兴起，同时相应地设立了由政府资助的阿马托洛伊（armatoloi，武装部队）以制止强盗的活动。
随着1683年“伟大的土耳其战争”的爆发，威尼斯在弗朗西斯科·莫罗西尼（Francesco Morosini）指挥下于1687年占领了整个半岛，并在1699年的卡尔洛维茨条约（Treaty of Karlowitz）中得到了奥斯曼帝国的承认。
威尼斯将其省份建立为“伯罗奔尼撒王国”（意大利语：Regno di Morea），但他们的统治并不受欢迎。
当奥斯曼帝国在1715年再次入侵半岛时，大多数当地希腊人对他们表示欢迎。
奥斯曼的再征服过程迅速而容易，威尼斯在1718年的帕萨罗维茨条约（Treaty of Passarowitz）中承认了这一点。
伯罗奔尼撒半岛现在成为了摩里亚艾亚列（Morea Eyalet）的核心，由摩拉维阿利（Mora valesi）领导，直到1780年他是一级帕夏（pasha，拥有三条马尾）并担任维齐尔（vizier）职务。
1780年后直到希腊独立战争，省长由一位穆哈西尔（muhassil）担任。
摩里亚的帕夏由几位下属官员协助，包括一名基督教翻译（dragoman），他是该省的高级基督教官员。
