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当佐助一行人回到木叶村的时候，大蛇丸联合砂之国发动的木叶崩溃行动以失败告终。
三代火影在最后，以自己的生命为代价，使用波风水门开发的尸鬼封印术，封印了大蛇丸的双手，以及被大蛇丸秽土转生的初代火影和二代火影。
大蛇丸发动的木叶崩溃计划，最终以大蛇丸的逃走、以及砂之国无条件的投降结束。
而和鸣人一起追击我爱罗的鹿丸，在最后关头，被赶来的阿斯玛救了一命；志乃中毒后，在失去意识前，前来增援的父亲志乃志微及时赶到，志乃志微用自己的寄环虫帮助志乃解除了毒素，追击我爱罗的木叶忍者，圆满完成任务，并且完好地保存了自己。
在战争刚开始时，由于大量的敌方忍者混入了木叶忍者或者普通民众中，加上又是突袭，木叶的忍者必须要先保证民众的撤离，在这个防御阶段，大量的木叶忍者以生命为代价，抵挡砂忍与音忍的攻击，让后方的人员能够快速的转移；在木叶的普通民众、特别是小孩、忍者学校里的学生，都安全转移到木叶的防御设施里后，木叶忍者吹起了反攻的号角。
毕竟木叶现在还是名义上的忍界第一忍村，实力比起三战后掉到最后的砂之国和大蛇丸刚成立不久的音忍加起来，还要强上一畴。
在此战中，木叶秘密的根部并没有投入到木叶保卫战中，以团蔵为首的长老团势力，实力也因此没有削弱。
这让后来成为木叶第五代火影的纲手，在担任火影后，处处受到长老团的压制，在处理木叶事务中，不能顺心所意，这也是纲手以后常常在火影办公室里，大发雷霆的原因。
